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CAS9 SAM过表达

名称:CAS9sam
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概括

CRISPR/Cas9是细菌和古细菌在生物进化过程中形成的一种适应性免疫防御机制,用来对抗入侵的病毒、噬菌体及外源DNA 。CRISP R/Cas9系统主要包括两个元件: Cas9核酸内切酶和向导RNA(gRNA),在gRNA引导下,Cas9蛋白在目的基因处进行切割,形成DNA双链断裂。细胞的修复系统修复断裂的双链DNA时,在缺口处随机插入或者删除若干核苷酸,通常会导致移码突变,从而发生基因功能改变,这时CRISPR/Cas9系统完成靶基因的编辑工作。同时通过对Cas9蛋白的改造来实现内源性过表达(SAM)和干扰(KI)。

SAM:点突变型的dCAS9蛋白失去切结合DNA序列的能力,dCAS9和转录激活因子VP64融合,加上能与RNA结合的MS2蛋白结合sgRNA,可特异性识别并结合目标基因的启动子。MS2蛋白上连接p65和HSF1转录激活蛋白。通过多种转录激活蛋白的协同作用,形成转录激活复合物,能够强效激活内源性目的基因的转录。

KI:不同于RNAi沉默方法,CRISPRi dCas9-KRAB系统在DNA水平上提供可抑制基因的表达。这使得高度特异性抑制非编码RNA,miRNA,反义转录物和核定位的RNA成为可能。

CRISPR SAM

(转录激活)

  点突变型的dCAS9蛋白失去切结合DNA序列的能力,dCAS9和转录激活因子VP64融合,加上能与RNA结合的MS2蛋白结合sgRNA,可特异性识别并结合目标基因的启动子。MS2蛋白上连接p65和HSF1转录激活蛋白。通过多种转录激活蛋白的协同作用,形成转录激活复合物,能够强效激活内源性目的基因的转录。

Synergistic Activation Mediato简称SAM。

组成:一个完整的CRISPR dCas9 SAM慢病毒载体系统包含两个部分:

载体元件

CRISPR dCas9 SAM表达载体:

辅助质粒:plenti CRISPR dCAS9: hu6-SgRNA-NLS-dCas9-Flag-NLS-VP64-P2A-puro-WPRE

gRNA表达载体:plenti CRISPR dCAS9: EF1A-MS2(N55K)-SV40 NLS-P65-HSF1-T2A-Blast-WPRE

技术优势:

1. 相比于传统的过表达手段,SAM系统不局限于目的基因编码序列的长短(传统过表达手段很难实现编码序列大于10kb的基因过表达);基因太长或者要过表达的基因有多转录本,只要是由一个启动子启动的,都可以使用该系统进行内源过表达。

2.同时对于长链非编码RNA以及miRNA等都有很好的转录激活作用。